Mitsuha adalah gadis SMA yang tinggal di ujung kota kecil Itomori dekat perspektur Gifu yang letaknya terpencil dekat dan dekat dengan gunung. Mitsuha sering mengeluh arena keterbatasan kota tempatnya tinggal tersebut dan suatu hari berniat pindah ke Tokyo.

Taki adalah cowok SMA yang tinggal di pusat Tokyo. Ia menghabiskan waktu sehari-hari bermain dengan teman-temannya, bekerja paruh waktu di restoran Itali, dan juga tertarik dengan arsitektur serta menggambar pemandangan.

Suatu hari, keduanya bangun dan bertukar tubuh dan saling menjalani kehidupan sehari-hari. Berawal dari mimpi dan time leap, akankah mereka berdua bisa bertemu dan kembali ke tubuh masing-masing?