Setting cerita ada pada zaman medieval yaitu zaman dimana umat manusia mewaspadai keberadaan sebuah mahluk pemangsa bernama Yoma.
 
Fokus cerita ada pada seorang anak laki-laki bernama Raki yang telah kehilangan kedua orang tuanya karena serangan dari para Yoma dan kemudian Raki memutuskan untuk mengikuti seorang Claymore bernama Clare karena kagum dan balas budi sebab elah menyelamatkan nyawanya.
 
Claymore sendiri merupakan pasukan anti-yoma yang sudah dilatih sejak kecil oleh sebuah organisasi tanpa nama dibawah naungan Pemerintah. Dengan memakan Yoma, para Claymore yang semulanya memang manusia setengah Yoma dapat bertambah kekuatannya, kecepatannya serta daya tahan layaknya seekor Yoma atau bahkan melebihi Yoma yang telah dimakan tersebut.
 
Bagaimanakah perjuangan Clare serta Raki dalam membasmi semua Yoma?