Dalam waktu dekat, sebagian besar permukaan bumi akan tenggelam akibat kenaikan permukaan air laut yang tidak dapat dijelaskan. Natsuki Ikaruga, seorang pemuda yang pindah dari kota ke pedesaan di tepi laut. Dia kehilangan salah satu kakinya karena kecelakaan saat masih kecil.

Neneknya yang seorang ahli geologi kelautan, mewariskan kapal selam dan utang-utangnya. Untuk mendapatkan “masa depannya yang hilang”, Natsuki menyelam ke gudang bawah air yang konon tempat warisan neneknya terkubur.

Apa yang ditemukannya di sana adalah seorang gadis misterius bernama Atri, tertidur di dalam perangkat yang mirip seperti peti mati. Dia adalah robot super canggih yang memiliki emosi dan mirip manusia.

“Aku ingin memenuhi perintah terakhir yang ditinggalkan tuanku untuk menjadi kakinya Natsuki”, kata Anri yang berhasil diselamatkan dari dasar laut.

Angin musim panas berhembus, kisah tak terlupakan seorang pemuda dan gadis robot di kota damai yang tenggelam ini pun dimulai.