Yona adalah putri tunggal dan pewaris dari kerajaan Kouka. Ibunya tewas oleh pembunuh bayaran ketika dirinya masih kecil dan membuatnya dirawat oleh ayah tercintanya, Emperor Il.
 
Yona dibesarkan tanpa kepedulian oleh ayah maupun keluarganya yang lain karena ibunya yang sudab meninggal, bahkan dirinya tak pernah tahu percecokan dan keadaan dunia luar karena khawarir akan terjadi kejadian yang sama dengan tragedi pembunuhan ibunya.
 
Suatu hari ayahnya terbunuh dan Yona mendapati bahwa Soo-Won, sepupunya sendiri lah yang telah membunuh ayahnya lalu melakukan kudeta guna mendapatkan tahta kerajaan Kouka.
 
Yona kemudian memutuskan untuk melarikan diri ke Fuuga tempat kelahiran Hak Son, pengawal pribadinya. Dan disinilah perjalanan Yona untuk memulai hidup baru dimulai!